名侦探柯南：绀碧之棺，是一部由山本泰一郎执导，高山南、山崎和佳奈、神谷明、山口胜平、林原惠美等众多演员主演的电影。而柯南侦探：蔚蓝之匣同样由这个团队制作。两部电影都讲述了柯南和小五郎领着一队人马前往神海岛度假，并意外卷入了关于海底宫殿和女海盗宝藏的传说中。 在海底宫殿附近潜水时，小兰和园子遭遇了猎人们的袭击。虽然幸运地逃生了，但是柯南对猎人死亡情况产生怀疑，并开始展开调查。他相信这与传说中的宝藏有关联，并试图揭开真相。 当他发现“Jolly Roger（海盗旗）”时，以为找到了线索，但却被突然现身并将之前发现的宝藏偷走的猎人打乱计划。小兰和园子落入险境中无法自拔。 究竟隐藏在传说中的信息是什么？“海底宫殿”又隐藏着怎样的秘密？随着故事推进，在追寻答案过程中不断有新谜题浮出水面……